PENGEMBANGAN METODE KORESPONDENSI DALAM REDUKSI LOKUS STR
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Institut Teknologi Bandung
Author
NATHANIA YONATHAN (NIM 10104081), VANESSA (STUDENT ID : )
Subject
Datestamp
0000-00-00 00:00:00
Abstract :
Identifikasi melalui DNA menghasilkan identitas yang mutlak dan akurat. Namun di balik keunggulannya, identifikasi ini membutuhkan biaya yang tidak sedikit. Jika efisiensi dapat diterapkan, akan sangat bermanfaat dalam identifikasi. Identifikasi individu melalui DNA inti sel adalah dengan memanfaatkan lokus Short Tandem Repeat (STR). Saat ini dengan pemanfaatan 13 lokus STR, identitas manusia sudah dapat ditentukan. Efisiensi biaya dan waktu dapat dilakukan dengan mereduksi banyaknya lokus STR. Tugas Akhir ini memfokuskan permasalahan reduksi lokus STR dengan metode korespondensi. Dari data STR dibangun kontingensi lokus terhadap alel, selanjutnya ditentukan bidang proyeksi optimal melalui Singular Value Decomposition (SVD). Proyeksi lokus dan alel pada bidang tersebut memberikan informasi pengelompokkan lokus berdasarkan informasi kemiripan alel. Pengelompokkan ini memberikan solusi dari masalah reduksi lokus. Metode korespondensi pada studi kasus 9 lokus dan 103 alel menyarankan 5 kelompok lokus, yaitu {1,2}, {3}, {4,6}, {5}, dan {7,8,9}. Selanjutnya diseleksi secara manual wakil lokus dari masing-masing kelompok dengan kendala duplikasi minimum. Prosedur seleksi menghasilkan pilihan lima lokus {1,3,5,6,8} dengan kualitas 100%, reduksi empat lokus{1,3,5,6}dengan kualitas 99%.
Identifikasi melalui DNA menghasilkan identitas yang mutlak dan akurat. Namun di balik keunggulannya, identifikasi ini membutuhkan biaya yang tidak sedikit. Jika efisiensi dapat diterapkan, akan sangat bermanfaat dalam identifikasi. Identifikasi individu melalui DNA inti sel adalah dengan memanfaatkan lokus Short Tandem Repeat (STR). Saat ini dengan pemanfaatan 13 lokus STR, identitas manusia sudah dapat ditentukan. Efisiensi biaya dan waktu dapat dilakukan dengan mereduksi banyaknya lokus STR. Tugas Akhir ini memfokuskan permasalahan reduksi lokus STR dengan metode korespondensi. Dari data STR dibangun kontingensi lokus terhadap alel, selanjutnya ditentukan bidang proyeksi optimal melalui Singular Value Decomposition (SVD). Proyeksi lokus dan alel pada bidang tersebut memberikan informasi pengelompokkan lokus berdasarkan informasi kemiripan alel. Pengelompokkan ini memberikan solusi dari masalah reduksi lokus. Metode korespondensi pada studi kasus 9 lokus dan 103 alel menyarankan 5 kelompok lokus, yaitu {1,2}, {3}, {4,6}, {5}, dan {7,8,9}. Selanjutnya diseleksi secara manual wakil lokus dari masing-masing kelompok dengan kendala duplikasi minimum. Prosedur seleksi menghasilkan pilihan lima lokus {1,3,5,6,8} dengan kualitas 100%, reduksi empat lokus{1,3,5,6}dengan kualitas 99%.
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
