PENAMBATAN MOLEKULAR SENYAWA ANTIVIRUS PADA RESEPTOR SPIKE PROTEIN SEBAGAI AGEN TERAPEUTIK COVID-19
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
UNIVERSITAS BAKTI TUNAS HUSADA
Author
DENA, SOPHIA
Subject
S1-Skripsi Farmasi
Datestamp
2021-09-06 14:59:51
Abstract :
Penambatan molekular senyawa antivirus pada reseptor Spike Protein sebagai agen terapeutik COVID-19 telah berhasil dilakukan dengan menggunakan metode molecular docking. Spike Protein menjadi target dalam pengembangan antivirus terhadap SARS-CoV-2, karena pada daerah Spike Protein ini cenderung bermutasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi penambatan molekular antara ligan antivirus dengan reseptor Spike Protein seperti ikatan hidrogen, ikatan hidrofobik, residu asam amino, dan nilai binding energy. Senyawa antivirus yang digunakan antara lain remdesivir, oseltamivir, lopinavir, ritonavir, favipiravir, ribavirin, umifenovir, hidroksiklorokuin, dan klorokuin. Sedangkan reseptor yang digunakan antara lain 6LZG, 6M0J, 6VW1, 6YLA, 7BZ5, dan 7LOP. Metode docking pada penelitian ini menggunakan perangkat lunak AutoDock Tools 1.5.6 dan visualisasi hasil docking menggunakan perangkat lunak Discovery Studio Visualizer v20. Hasil analisis docking menunjukkan senyawa remdesivir yang memiliki nilai binding energy paling rendah dibandingkan senyawa lain yaitu sebesar -7,60 kkal/mol pada kode reseptor 6M0J. Maka dapat diprediksi bahwa senyawa remdesivir memiliki interaksi yang stabil dan efektifitas yang lebih baik sehingga dapat dijadikan sebagai kandidat pengobatan COVID-19.
Penambatan molekular senyawa antivirus pada reseptor Spike Protein sebagai agen terapeutik COVID-19 telah berhasil dilakukan dengan menggunakan metode molecular docking. Spike Protein menjadi target dalam pengembangan antivirus terhadap SARS-CoV-2, karena pada daerah Spike Protein ini cenderung bermutasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi penambatan molekular antara ligan antivirus dengan reseptor Spike Protein seperti ikatan hidrogen, ikatan hidrofobik, residu asam amino, dan nilai binding energy. Senyawa antivirus yang digunakan antara lain remdesivir, oseltamivir, lopinavir, ritonavir, favipiravir, ribavirin, umifenovir, hidroksiklorokuin, dan klorokuin. Sedangkan reseptor yang digunakan antara lain 6LZG, 6M0J, 6VW1, 6YLA, 7BZ5, dan 7LOP. Metode docking pada penelitian ini menggunakan perangkat lunak AutoDock Tools 1.5.6 dan visualisasi hasil docking menggunakan perangkat lunak Discovery Studio Visualizer v20. Hasil analisis docking menunjukkan senyawa remdesivir yang memiliki nilai binding energy paling rendah dibandingkan senyawa lain yaitu sebesar -7,60 kkal/mol pada kode reseptor 6M0J. Maka dapat diprediksi bahwa senyawa remdesivir memiliki interaksi yang stabil dan efektifitas yang lebih baik sehingga dapat dijadikan sebagai kandidat pengobatan COVID-19.
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
