SKRINING VIRTUAL SENYAWA ALKALOID SEBAGAI INHIBITOR MAIN PROTEASE, RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE DAN ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME 2 PADA COVID-19
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
UNIVERSITAS BAKTI TUNAS HUSADA
Author
Hapid, Puji Ainul
Subject
S1-Skripsi Farmasi
Datestamp
2021-09-06 14:31:37
Abstract :
Abstrak Penyebaran infeksi SARS-CoV2 penyebab COVID-19 secara global masih mengalami peningkatan hingga saat ini. Peningkatan tersebut ditentukan oleh aktivitas main protease dan RNA-dependent RNA polymerase sebagai fasilitator replikasi ssRNA SARS-CoV2. Selain itu, interaksi protein spike dengan reseptor angiotensin converting enzyme 2 menyebabkan SARS-CoV2 dapat melewati membrane sel. Senyawa alkaloid memiliki aktivitas sebagai agen antivirus yang mampu menghambat proses replikasi ssRNA SARS-Cov2. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan senyawa alkaloid sebagai kandidat potensial pengobatan COVID-19. Metode yang digunakan ialah virtual screening dengan molecular docking dan molecular dynamics serta prediksi profil farmakokinetik dan toksisitas. Hasil screening alkaloid menunjukan senyawa hupehenine memiliki interaksi terhadap main protease, senyawa yubeinine memiliki interaksi terhadap RNA-dependent RNA polymerase dan senyawa aloperin memiliki interaksi terhadap angiotensin converting enziyme 2 dilihat dari energi bebas Gibbs (ΔG) yang dihasilkan yaitu -10.44 kkal/mol, -8.72 kkal/mol dan -4.08 kkal/mol secara berurutan. Pada molecular dynamics diperoleh bahwa senyawa yubeinine memiliki nilai energi total dari metode MMGBSA yang lebih kecil dari pembanding yaitu sebesar -55.9563 kkal/mol sehingga dijadikan sebagai senyawa kandidat pengobatan COVID-19. Senyawa yubeinine yang diperoleh memiliki absorpsi, distribusi dan metabolisme yang baik akan tetapi memiliki sifat mutagenik. Kata kunci: COVID-19, main protease, RNA-dependent RNA polymerase, angiotensin converting enziyme 2, skrining virtual, alkaloid. Oleh : Puji Ainul Hapid 31117035
Abstrak Penyebaran infeksi SARS-CoV2 penyebab COVID-19 secara global masih mengalami peningkatan hingga saat ini. Peningkatan tersebut ditentukan oleh aktivitas main protease dan RNA-dependent RNA polymerase sebagai fasilitator replikasi ssRNA SARS-CoV2. Selain itu, interaksi protein spike dengan reseptor angiotensin converting enzyme 2 menyebabkan SARS-CoV2 dapat melewati membrane sel. Senyawa alkaloid memiliki aktivitas sebagai agen antivirus yang mampu menghambat proses replikasi ssRNA SARS-Cov2. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan senyawa alkaloid sebagai kandidat potensial pengobatan COVID-19. Metode yang digunakan ialah virtual screening dengan molecular docking dan molecular dynamics serta prediksi profil farmakokinetik dan toksisitas. Hasil screening alkaloid menunjukan senyawa hupehenine memiliki interaksi terhadap main protease, senyawa yubeinine memiliki interaksi terhadap RNA-dependent RNA polymerase dan senyawa aloperin memiliki interaksi terhadap angiotensin converting enziyme 2 dilihat dari energi bebas Gibbs (ΔG) yang dihasilkan yaitu -10.44 kkal/mol, -8.72 kkal/mol dan -4.08 kkal/mol secara berurutan. Pada molecular dynamics diperoleh bahwa senyawa yubeinine memiliki nilai energi total dari metode MMGBSA yang lebih kecil dari pembanding yaitu sebesar -55.9563 kkal/mol sehingga dijadikan sebagai senyawa kandidat pengobatan COVID-19. Senyawa yubeinine yang diperoleh memiliki absorpsi, distribusi dan metabolisme yang baik akan tetapi memiliki sifat mutagenik. Kata kunci: COVID-19, main protease, RNA-dependent RNA polymerase, angiotensin converting enziyme 2, skrining virtual, alkaloid. Oleh : Puji Ainul Hapid 31117035
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
