Sistem penggajian staf yang bersangkutan dengan presensi staf pada Program Studi Teknologi Informasi Fakultas Teknik Universitas Muhammadiyah Yogyakarta menggunakan sistem rekap manual oleh staf tata usaha program studi. Sistem penggajian yang masih menggunakan metode manual ini memakan waktu agak lama dalam proses rekapnya. Untuk mengatasi masalah tersebut, dibuatlah sebuah sistem presensi dan penggajian berbasis website untuk membantu staf tata usaha merekap presensi dan penggajian dengan cepat dan akurat. Pembuatan website penggajian ini dilakukan dengan metode waterfall. Dengan metode ini, pembuatan website akan menjadi lebih teratur. Pembuatan website ini juga menggunakan bahasa pemrograman PHP dengan framework Codeigniter. Kata kunci: penggajian, website, PHP, Codeigniter.