DESAIN DNA REKOMBINAN NANOBODI DENGAN MENGGUNAKAN PLASMID pET-28a
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia Bandung
Author
ADE PIA HANDAYANI, -
Subject
QH301 Biology
Datestamp
2024-07-25 04:07:29
Abstract :
Nanobodi merupakan molekul immunoglobulin yang memiliki ukuran kecil, dapat berpenetrasi kedalam jaringan, mudah diproduksi dan larut dalam air. Nanobodi dapat digunakan sebagai komponen dalam kit diagnostik, salah satunya yaitu untuk mendeteksi kortisol. Penelitian ini bertujuan untuk membuat desain plasmid rekombinan yang membawa gen nanobodi. Urutan asam amino nanobodi diambil dari Protein Data Bank (PDB) dengan kode 6ITP kemudian diubah menjadi DNA. Pengecekan kodon dilakukan dengan menggunakan Graphical Codon Usage Analyzer (GCUA), sedangkan peta restriksi dianalisis menggunakan NEBCutter. Primer dibuat untuk memperbanyak gen nanobodi dengan menambahkan sisi restriksi enzim yang sesuai dengan plasmid pET-28a dan dilakukan pengecekan inframe. Hasil penelitian menunjukan bahwa gen nanobodi terdiri dari 381 basa dan dapat diperbanyak dengan CTTAAGATGCAGGTTCAGCTGCAGGAA-3' dan primer reverse yang ditambahkan sisi restriksi enzim Xhol 5'-GAGCTCATGAGCTGCTAACTGGAACCTG - 3'. Gen nanobodi dapat menyisip kedalam plasmid pET-28a tanpa mengubah pembacaan.
Nanobodi merupakan molekul immunoglobulin yang memiliki ukuran kecil, dapat berpenetrasi kedalam jaringan, mudah diproduksi dan larut dalam air. Nanobodi dapat digunakan sebagai komponen dalam kit diagnostik, salah satunya yaitu untuk mendeteksi kortisol. Penelitian ini bertujuan untuk membuat desain plasmid rekombinan yang membawa gen nanobodi. Urutan asam amino nanobodi diambil dari Protein Data Bank (PDB) dengan kode 6ITP kemudian diubah menjadi DNA. Pengecekan kodon dilakukan dengan menggunakan Graphical Codon Usage Analyzer (GCUA), sedangkan peta restriksi dianalisis menggunakan NEBCutter. Primer dibuat untuk memperbanyak gen nanobodi dengan menambahkan sisi restriksi enzim yang sesuai dengan plasmid pET-28a dan dilakukan pengecekan inframe. Hasil penelitian menunjukan bahwa gen nanobodi terdiri dari 381 basa dan dapat diperbanyak dengan CTTAAGATGCAGGTTCAGCTGCAGGAA-3' dan primer reverse yang ditambahkan sisi restriksi enzim Xhol 5'-GAGCTCATGAGCTGCTAACTGGAACCTG - 3'. Gen nanobodi dapat menyisip kedalam plasmid pET-28a tanpa mengubah pembacaan.
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
