PENCARIAN LOKASI GEN DAN DESAIN PRIMER BIOSURFAKTAN DARI BAKTERI Exiguobacterium profundum DAN Staphylococcus epidermidis MENGGUNAKAN METODE BIOINFORMATIKA
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia Bandung
Author
ELIZABETH CINTIA CHRISTIN ANGGELA, -
Subject
QH301 Biology
Datestamp
2024-07-27 01:33:53
Abstract :
Biosurfaktan adalah surfaktan biodegradable yang dihasilkan dari metabolisme sel mikroorganisme. Biosurfaktan dapat mengatasi permasalah yang ditimbulkan oleh jenis surfaktan yang banyak digunakan. Bakteri yang dapat menghasilkan biosurfaktan diantaranya adalah bakteri Exiguobacterium profundum dan Staphylococcus epidermis. Telah dilakukan penelitian penyejajaran DNA biosurfaktan menggunakan aplikasi BLAST dan Primer-BLAST di situs NCBI dengan tujuan untuk mengetahui lokasi gen dan jenis biosurfaktan serta desain primer yang dihasilkan. Hasil analisis penyejajaran antara sekuen nukleotida dengan genom bakteri Staphylococcus epidermis strain ATCC 12228 yang diperoleh adalah Fengcyin pada lokasi 23366602-2337467 dan pada bakteri Exiguobacterium profundum adalah Pumilacidin pada lokasi 87-1474. Hasil desain primer pada bakteri Staphylococcus epidermis strain ATCC 12228 dengan amplikon sebesar 350 pasang basa yaitu primer Forward 5' TGCGGAAGATTCCCTACTGC 3' dan primer Reverse 5' AGGGAATCTTCCGCAATGGG 3' sedangkan bakteri Exiguobacterium profundum menghasilkan amplikon sebesar 597 pasang basa yaitu primer Forward 5' ATGCACCACCTGTCACTCTG 3'.
Biosurfaktan adalah surfaktan biodegradable yang dihasilkan dari metabolisme sel mikroorganisme. Biosurfaktan dapat mengatasi permasalah yang ditimbulkan oleh jenis surfaktan yang banyak digunakan. Bakteri yang dapat menghasilkan biosurfaktan diantaranya adalah bakteri Exiguobacterium profundum dan Staphylococcus epidermis. Telah dilakukan penelitian penyejajaran DNA biosurfaktan menggunakan aplikasi BLAST dan Primer-BLAST di situs NCBI dengan tujuan untuk mengetahui lokasi gen dan jenis biosurfaktan serta desain primer yang dihasilkan. Hasil analisis penyejajaran antara sekuen nukleotida dengan genom bakteri Staphylococcus epidermis strain ATCC 12228 yang diperoleh adalah Fengcyin pada lokasi 23366602-2337467 dan pada bakteri Exiguobacterium profundum adalah Pumilacidin pada lokasi 87-1474. Hasil desain primer pada bakteri Staphylococcus epidermis strain ATCC 12228 dengan amplikon sebesar 350 pasang basa yaitu primer Forward 5' TGCGGAAGATTCCCTACTGC 3' dan primer Reverse 5' AGGGAATCTTCCGCAATGGG 3' sedangkan bakteri Exiguobacterium profundum menghasilkan amplikon sebesar 597 pasang basa yaitu primer Forward 5' ATGCACCACCTGTCACTCTG 3'.
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
