Abstract :
Nur Alam, 2019. Prediksi Struktur Tiga Dimensi Protein ?-NGF pada Burung
Merpati (Columba livia) dan Pemanfaatannya sebagai Sumber Belajar. Skripsi,
Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan Matematika dan Ilmu
Pengetahuan Alam, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Tadulako.
Pembimbing I Made Budiarsa.
Protein ?-NGF berperan dalam kelangsungan hidup sel neuron dan
diferensiasi embrio aves yang diekspresikan oleh gen NGF. Informasi protein ?-NGF
telah diidentifikasi pada ayam dan masih terbatas dilaporkan pada burung Merpati.
Tujuan penelitian adalah memprediksi struktur tiga dimensi untuk menambah
informasi dalam karakteristik protein ?-NGF burung Merpati. Protein diperoleh dari
server UniProt dengan kode akses B4ZE95 dengan template 1.www.1.B. yang
diprediksi menggunakan server Swiss-Model dengan pendekatan homologi dan
visualisasi protein pada program Chimera. Hasil analisis menunjukkan bahwa protein
?-NGF burung Merpati dan template memiliki nilai identity sebesar 89.91%,
QMEAN 0.51 serta GMQE 0.44. Struktur tiga dimensi protein memiliki asam amino
hidrofobik Ile, Leu, Trp, Lys, Phe, Val, Ala, Thr, His, Gly, Met, Cys; karboksil Glu,
Ser, Asp; amina Lys, Thr dengan 83 ikatan hidrogen. Implementasi kajian ini yang
disusun dalam bentuk modul layak digunakan sebagai sumber belajar dengan
persentase sebesar 88%.
Kata kunci: ?-NGF, Struktur Protein, Swiss-Model, Chimera